Masjid Al-Mustofa memiliki gaya arsitektur yang unik, yaitu perpaduan antara gaya Cirebon dan Banten.
Pada bagian dalam masjid, terdapat tiang-tiang kokoh dengan goresan sebanyak sembilan buah yang menandakan jumlah Wali Songo.
Selain itu banyak juga peninggalan bersejarah di sini, di antaranya ada Al-Quran serta naskah khotbah Sholat Jumat yang ditulis tangan secara langsung oleh Tubagus H Mustofa Bakri.
Bahkan kondisinya masih terawat dan disimpan dengan baik di sebuah kotak kaca.
Kini Masjid Al-Mustofa sudah diresmikan oleh pemerintah Kota Bogor sebagai bangunan cagar budaya pada tahun 2010.
Meski sudah tua, masjid ini masih aktif digunakan sebagai tempat berkumpulnya umat Islam untuk melaksanakan shalat dan kegiatan keagamaan lainnya.
Selain itu, masjid ini juga menjadi tempat wisata religi yang populer di Bogor, yang dikunjungi oleh banyak wisatawan dari berbagai daerah.
(Tribunners/Fanny Anggraeni)