Satu diantara program terobosan unggulan Irwandi Yusuf saat menjadi gubernur pada periode 2006-2012 adalah Program Jaminan Kesehatan Aceh (JKA), dimana pemerintah memberikan layanan kesehatan gratis bagi masyarakat Aceh.
Dan program ini kemudian diadopsi oleh pemerintah Indonesia dengan sebutan Jaminan Kesehatan Nasional (JKN).